De genotype Det er definert som settet med gener (med deres alleler) som koder for en bestemt egenskap eller karakteristikk, som skilles fra andre ved en bestemt funksjon eller sekvens. Imidlertid definerer noen forfattere det også som den delen av genomet som gir opphav til fenotypen eller som den alliske konstitusjonen til en organisme..
Selv om de er relaterte, er ikke begrepene genotype og fenotype den samme. I denne forstand er fenotype definert som settet med synlige egenskaper til en organisme som er resultatet av ekspresjonen av dens gener, og genotypen som settet med gener som gir opphav til en bestemt fenotype..
Dermed har to organismer samme genotype hvis de deler de samme genene, men det samme gjelder ikke for to organismer som tilsynelatende har samme fenotype, siden lignende egenskaper kan være et produkt av forskjellige gener..
Det var den danske botanikeren Wilhelm Johannsen, i 1909, som først introduserte begrepene genotype og fenotype i vitenskapen, i en lærebok med tittelen "Elementene i en teori om nøyaktig arv ", som var produktet av en serie eksperimenter han utførte på kryss av rene bygg og erter.
Verkene hans, sannsynligvis inspirert av de som ble laget noen år tidligere av Gregorio Mendel, betraktet som "far til genetikk”, Tillot ham å presisere at genotypen til en organisme gir opphav til fenotypen gjennom forskjellige utviklingsprosesser og under påvirkning av miljøet.
Artikkelindeks
Genotypen er ikke akkurat den samme som genomet. Her er skillet mellom de to begrepene:
- "Genom" refererer til alle gener som et individ har arvet fra foreldrene sine og hvordan disse fordeles på kromosomene i kjernen..
- "Genotype" er begrepet som brukes for å referere til for eksempel settet med gener og deres varianter som gir opphav til et bestemt trekk, hvorfra et individ skilles ut fra en populasjon eller en art.
Selv om det er tilbøyelig til å gjennomgå endringer på grunn av mutasjoner gjennom en organismes livshistorie, er genotypen et relativt ufravikelig trekk hos individer, siden, i teorien, er gener som arves de samme fra unnfangelse til død..
I en naturlig populasjon har allelene som utgjør en gitt genotype forskjellige utseendefrekvenser; det vil si at noen forekommer i populasjoner mer enn andre, og dette er blant annet relatert til distribusjon, miljøforhold, tilstedeværelsen av andre arter osv..
Begrepet "genotype vill"Definerer den første allelvarianten som finnes i naturen, men refererer ikke nødvendigvis til den allelen som oftest finnes i en populasjon; og begrepet "genotype mutant”Brukes ofte til å definere andre alleler enn naturen.
For å skrive en genotype brukes store og små bokstaver vanligvis for å skille mellom allelene som et individ har, enten det er homozygot eller heterozygot. Store bokstaver brukes til å definere dominerende alleler og små bokstaver for recessive..
Enkeltpersoner arver gener fra foreldrene sine, men ikke de endelige produktene som fås fra deres uttrykk, fordi disse er avhengige av mange eksterne faktorer og historien om deres utvikling..
I samsvar med dette og kun refererer til miljøfaktorer, kan en genotype gi opphav til mer enn en fenotype. Settet med mulige "resultater" av samspillet mellom en bestemt genotype og forskjellige miljøer er det forskere har kalt "genotype reaksjonsnorm".
Normen for reaksjon av en genotype er da en slags "kvantifisering" eller opptak av de synlige karakteristikkene som oppnås fra samspillet mellom en genotype og visse miljøer. Det kan uttrykkes som grafer eller tabeller som "forutsier" de mulige resultatene.
Det er selvfølgelig klart at reaksjonsnormen kun refererer til en delvis genotype, en delvis fenotype og noen få miljøfaktorer, siden det i praksis er veldig vanskelig å forutsi absolutt alle interaksjoner og alle resultatene av disse..
Å bestemme genotypen eller "genotype" en organisme eller en populasjon av individer av samme art, gir mye verdifull informasjon om dens evolusjonære biologi, dens befolkningsbiologi, dens taksonomi, dens økologi og dens genetiske mangfold..
I mikroorganismer som bakterier og gjær, siden de har høyere multiplikasjons- og mutasjonshastigheter enn de fleste flercellede organismer, kan bestemmelse og kunnskap om genotypen kontrollere identiteten til koloniene i samlingene, samt å etablere noen kjennetegn ved epidemiologi, økologi og taksonomi av det samme.
For å bestemme genotypen er det nødvendig å skaffe prøver av organismen man vil jobbe med, og hvilke typer prøver som er nødvendige vil avhenge av hver organisme. Hos dyr kan det for eksempel tas prøver av forskjellige vev: halen, ørene, avføringen, håret eller blodet.
Genotypen til en organisme kan bestemmes eksperimentelt takket være bruken av noen moderne teknikker, som vil avhenge av den genomiske plasseringen av genene som skal studeres, budsjett og tid, brukervennlighet og ønsket ytelsesgrad..
Foreløpig inkluderer teknikkene som brukes til genotyping av en organisme, veldig ofte, bruk og analyse av molekylære markører for å oppdage polymorfier i DNA og andre mer avanserte teknikker som involverer genomsekvensering..
Blant de mest brukte markørene finner vi følgende:
- RFLP (begrensningsfragmentlengde polymorfier).
- AFLPs (Amplified Fragment Length Polymorphisms).
- RAPDs (tilfeldig amplifisert polymorf DNA).
- Mikrosatellitter eller SSR (gjentakelser i enkel sekvens).
- ASAPs (primere assosiert med spesifikke alleler).
- SNP (enkelt nukleotid polymorfier).
Og blant teknikkene som bruker sekvensering og hybridisering av spesifikke sonder er:
- Sekvensering etter Sanger-metoden.
- Genotyping med høy gjennomstrømning.
- Test "Goldengate”Fra Illumina.
- Genotyping etter sekvensering (GBS).
- TaqMan-analyse.
- Neste generasjons sekvensering.
- Microarrays.
- Hele genomet sekvensering.
Ingen har kommentert denne artikkelen ennå.