De TATA-boks, I cellebiologi er det en konsensus-DNA-sekvens som finnes i alle slekter av levende organismer og er allment konservert. Sekvensen er 5'-TATAAA-3 'og kan følges av noen gjentatte adeniner.
Kassens plassering er oppstrøms (eller oppstrøms, som det ofte kalles i litteraturen) fra begynnelsen av transkripsjonen. Dette er lokalisert i promoterregionen til gener, der foreningen med transkripsjonsfaktorer vil forekomme. I tillegg til disse faktorene, har RNA-polymerase II en tendens til å binde seg til TATA-boksen..
Selv om TATA-boksen er den viktigste promotorsekvensen, er det gener som mangler den.
Artikkelindeks
Begynnelsen av RNA-syntese krever at RNA-polymerase binder seg til spesifikke sekvenser i DNA, kalt promotere. TATA-boksen er konsensus-sekvensen til en promoter. Den kalles Pribnow-boksen i prokaryoter, og Goldberg-Hogness-boksen i eukaryoter.
Dermed er TATA-boksen en bevart region i DNA. Sekvensering av mange DNA-transkripsjonelle startregioner viste at konsensus-sekvensen, eller vanlig sekvens, er (5ʾ) T * A * TAAT * (3ʾ). Stillinger merket med en stjerne har høy homologi. Den siste rest T er alltid funnet hos promotorer av E coli.
Etter konvensjon blir basepar som tilsvarer begynnelsen av syntesen av et RNA-molekyl gitt positive tall, og basepar som går foran starten av RNA, får negative tall. TATA-boksen er i region -10.
På E coli, promoterregionen er mellom posisjonene -70 og +30. I denne regionen er det en andre konsensus-sekvens (5ʾ) T * TG * ACA (3ʾ) i posisjon -35. Tilsvarende har posisjoner merket med en stjerne høy homologi..
I eukaryoter har promoterregionene signalelementer som er forskjellige for hver av RNA-polymerasene. På E coli en enkelt RNA-polymerase identifiserer signalelementer i promotorregionen.
I tillegg er promoterregionene mer utbredt i eukaryoter. Det er forskjellige sekvenser, lokalisert i -30 og -100-regionen, som etablerer forskjellige kombinasjoner i de forskjellige promotorene.
I eukaryoter er det mange transkripsjonsfaktorer som samhandler med arrangører. For eksempel binder TFIID-faktoren til TATA-sekvensen. På den annen side er ribosomale RNA-gener strukturert i form av flere gener, en etterfulgt av en annen..
Variasjoner i konsensus-sekvensene av -10 og -35 regionene endrer bindingen av RNA-polymerase til promoterregionen. En enkelt baseparmutasjon forårsaker således en reduksjon i bindingshastigheten av RNA-polymerase til promoterregionen..
TATA-boksen deltar i binding og initiering av transkripsjon. På E coli, RNA-polymerase-holoenzymet består av fem α-underenhetertoββσ. Σ-underenheten binder seg til dobbeltstrenget DNA og beveger seg på jakt etter TATA-boksen, som er signalet som indikerer begynnelsen på genet.
Σ-underenheten til RNA-polymerase har en veldig høy promotorassosiasjonskonstant (i rekkefølgen 10elleve), som indikerer en høy gjenkjenningsspesifisitet mellom den og Pribnow-boksesekvensen.
RNA-polymerase binder seg til promoteren og danner et lukket kompleks. Deretter danner det et åpent kompleks preget av lokal åpning av 10 basepar av DNA-dobbeltspiralen. Denne åpningen er tilrettelagt fordi sekvensen til Pribnow-boksen er rik på AT.
Når DNA blir avviklet, dannes den første fosfodiesterbindingen og forlengelse av RNA begynner. Σ-underenheten frigjøres, og RNA-polymerase forlater promoteren. Andre RNA-polymerasemolekyler kan binde seg til promotoren og begynne transkripsjon. På denne måten kan et gen transkriberes mange ganger..
I gjær består RNA-polymerase II av 12 underenheter. Dette enzymet initierer transkripsjon ved å gjenkjenne to typer konsensus-sekvenser ved 5ʾ slutten av begynnelsen av transkripsjonen, nemlig: TATA-konsensus-sekvens; CAAT konsensus sekvens.
RNA-polymerase II krever proteiner, kalt TFII-transkripsjonsfaktorer, for å danne et aktivt transkripsjonskompleks. Disse faktorene er ganske bevart i alle eukaryoter..
Transkripsjonsfaktorer er proteinmolekyler som kan binde seg til DNA-molekylet og har evnen til å øke, redusere eller stoppe produksjonen av et spesifikt gen. Denne hendelsen er avgjørende for genregulering.
Dannelsen av transkripsjonskomplekset begynner med binding av TBP-proteinet ("TATA-binding protein") til TATA-boksen. I sin tur binder dette proteinet TFIIB, som også binder seg til DNA. TBP-TFIIB-komplekset binder seg til et annet kompleks bestående av TFIIF og RNA-polymerase II. På denne måten hjelper TFIIF RNA-polymerase II med å binde seg til promotoren..
Til slutt kommer TFIIE og TFIIH sammen og lager et lukket kompleks. TFIIH er en helikase og fremmer DNA-dobbeltstrengseparasjon, en prosess som krever ATP. Dette skjer i nærheten av startstedet for RNA-syntese. På denne måten dannes det åpne komplekset.
P53 proteinet er en transkripsjonsfaktor, også kjent som p53 tumor suppressor protein. Det er et produkt av en dominerende onkogen. Li-Fraumeni syndrom er forårsaket av en kopi av dette muterte genet, som forårsaker utvikling av karsinomer, leukemi og svulster.
P53 er kjent for å hemme transkripsjonen av noen gener og aktivere andres. For eksempel forhindrer p53 transkripsjon av gener med en TATA-promoter ved å danne et kompleks bestående av p53, andre transkripsjonsfaktorer og TATA-promoteren. Dermed holder p53 cellevekst under kontroll..
Ingen har kommentert denne artikkelen ennå.