De ribulose er et monosakkaridsukker eller karbohydrat som inneholder fem karbonatomer og en ketonfunksjonell gruppe i sin struktur, og det er derfor det er inkludert i gruppen ketopentoser.
Fire- og fem-karbon ketoser er navngitt ved å sette inn infiks “ul”I navnet på den tilsvarende aldosen. Så D-ribulose er ketopentosen som tilsvarer D-ribose, en aldopentose.
Dette sukkeret deltar i D-ribuloseformen som et mellomledd i forskjellige metabolske veier, som for eksempel i Calvin-syklusen. Mens bare i noen bakterier av slekter som Acetobacter Y Gluconobacter L-ribose oppnås som det endelige metabolske produktet. Av denne grunn brukes disse mikroorganismene til syntese på industrielt nivå..
Noen forbindelser avledet fra ribulose er et av de viktigste mellomproduktene i pentosefosfatveien. Denne veien er ment å generere NADPH, en viktig kofaktor som fungerer i nukleotidbiosyntese..
Det er industrielle mekanismer for å syntetisere L-ribulose som en isolert forbindelse. Den første isolasjonsmetoden som den ble oppnådd med besto av Levene og La Forge-metoden for isolering av ketoser fra L-xylose..
Til tross for de store fremskrittene innen industrielle metoder for syntese og rensing av kjemiske forbindelser, oppnås ikke L-ribulose som et isolert monosakkarid, oppnådd i kombinerte fraksjoner av L-ribose og L-arabinose..
Metoden for å oppnå L-ribulose mest brukt for tiden er rensing fra Gluconobacte frateurii IFO 3254. Denne arten av bakterier er i stand til å overleve under sure forhold og har en oksidasjonsvei fra ribitol til L-ribulose..
Artikkelindeks
Ribulose som et syntetisert, ekstrahert og renset reagens som ofte finnes som L-ribulose, er et fast, hvitt og krystallinsk organisk stoff. Som alle karbohydrater er dette monosakkaridet løselig i vann og har de typiske egenskapene til polare stoffer.
Som vanlig for resten av sakkaridene, har ribulose samme antall karbon og oksygenatomer, og dobbelt så mye i hydrogenatomer..
Den vanligste formen der ribulose kan finnes i naturen er i forbindelse med forskjellige substituenter og danner komplekse strukturer, generelt fosforylerte, slik som ribulose 5-fosfat, ribulose 1,5-bisfosfat, blant andre..
Disse forbindelser fungerer generelt som mellommenn og transportører eller "bærere" for fosfatgrupper i de forskjellige cellulære metabolske banene som de deltar i..
Ribulosemolekylet har et sentralt skjelett med fem karbonatomer og en ketongruppe på karbonet i C-2-stillingen. Som tidligere nevnt posisjonerer denne funksjonelle gruppen den i ketoser som ketopentose.
Den har fire hydroksylgrupper (-OH) festet til de fire karbonene som ikke er festet til ketongruppen, og disse fire karbonene er mettet med hydrogenatomer.
Ribulosemolekylet kan representeres i henhold til Fisher-projeksjonen i to former: D-ribulose eller L-ribulose, hvor L-formen er stereoisomeren og enantiomeren av D-formen og omvendt..
Klassifiseringen av D- eller L-formen avhenger av orienteringen av hydroksylgruppene i det første karbonatomet etter ketongruppen. Hvis denne gruppen er orientert mot høyre side, tilsvarer molekylet i Fishers representasjon D-ribulose, ellers hvis det er mot venstre side (L-ribulose).
I Haworth-projeksjonen kan ribulose være representert i to ekstra strukturer avhengig av orienteringen av hydroksylgruppen i det anomere karbonatomet. I β-stillingen er hydroksylen orientert mot den øvre delen av molekylet; mens posisjonen α orienterer hydroksylen mot bunnen.
I følge Haworth-projeksjonen kan det således være fire mulige former: β-D-ribulose, α-D-ribulose, β-L-ribulose eller α-L-ribulose.
De fleste celler, spesielt de som deler seg raskt og raskt, for eksempel benmarg, tarmslimhinne og tumorceller, bruker ribulose-5-fosfat, som er isomerisert til ribose-5-fosfat i den oksidative banen til pentosefosfat, for å produsere nukleinsyrer (RNA og DNA) og koenzymer som ATP, NADH, FADH2 og koenzym A.
Denne oksidative fasen av pentosefosfat inkluderer to oksidasjoner som omdanner glukose 6-fosfat til ribulose 5-fosfat, og reduserer NADP + til NADPH.
I tillegg aktiverer ribulose-5-fosfat indirekte fosfofruktkinase, et essensielt enzym i glykolytisk vei..
Calvin-syklusen er karbonfikseringssyklusen som finner sted i fotosyntetiske organismer etter de første reaksjonene av fotosyntese..
Det er bevist ved å markere metoder i tester utført av forskjellige forskere at ved å markere karbon i C-1-posisjonen til ribulose-1,5-bisfosfat, blir karbondioksid fiksert i dette mellomproduktet under Calvin-syklusen, noe som gir opprinnelse til to 3-fosfoglyseratmolekyler: en merket og en umerket.
RuBisCO (Ribulose 1,5-bisfosfat karboksylase / oksygenase) regnes som det mest vanlige enzymet på planeten og bruker ribulose 1,5-bisfosfat som substrat for å katalysere inkorporeringen av karbondioksid og produksjonen av 1,3-difosfoglyserat i. calvin-syklusen.
Nedbrytningen av dette ustabile mellomproduktet, 1,3-difosfoglyserat, av seks karbonatomer, katalyseres også av RuBisCO, som er den som formidler dannelsen av to molekyler med 3 karbonatomer (3-fosfoglyserat).
Enol-1-ELLER-karboksyfenylamino-1-deoksyribulosefosfat deltar som en mellommetabolitt i biosyntese av tryptofan fra korismat i bakterier og planter. I dette trinnet frigjøres ett molekyl karbondioksid og et vann, og det produserer også et molekyl med indol-3-glyserolfosfat..
Bakterier bruker L-ribulose også i banene som brukes til etanolmetabolisme. I tillegg har disse mikroorganismene et enzym kjent som L-arabinose-isomerase, som modifiserer arabinose for å syntetisere L-ribulose..
L-ribulosekinase fosforylerer denne metabolitten nedstrøms for å danne L-ribulose-5-fosfat, som kan komme inn i pentosefosfatveien for produksjon av sukker for nukleinsyreryggraden og andre essensielle molekyler.
Ingen har kommentert denne artikkelen ennå.